Este programa foi premiado com menção honrosa da UNESCO – PRÊMIO EDUCAÇÃO PARA A PAZ – 2006. Foi outorgado à Fundación para la Reconciliación em reconhecimento à contribuição de seus projetos de construção de paz na Colômbia e no mundo.

Em agosto de 2004, o Conselho Distrital de Bogotá, premiou a Fundación para la Reconciliadión com a medalha de mérito José Acevedo y Gómez no grau de CRUZ DE OURO em reconhecimento a valiosa contribuição para os direitos humanos, na convivência e na pedagogia da reconciliação.
 
Em novembro de 2007, o Congresso da República da Colômbia concedeu o prêmio CRUZ GRAN CABALLERO da Orden de la Democracia Simon Bolivar.